除名对工龄的影响

本人41岁，男性，1988年中专毕业后分配至济南一家棉纺厂工作，后来工厂接近停产，93年起遂自谋职业。94-2008年在一家合作企业工作，08年10月离职。
保险的缴纳情况和档案管理：
93年之前由棉纺厂缴纳，有完整档案
1999-2008年由合资企业缴纳 无任何档案
2009年7月起按照自由职业自行缴纳养老和医疗保险

在办理自行缴纳养老保险的期间从原纺织厂提出个人档案，其中有1996年企业对我除名的决定，目前该企业已经破产由企业的原法人代表更换公司名称后继续经营。
去市养老处征询，答复：当时的企业搞假破产，开除了许多职工，逃避养老保险义务，后经政府有关部门协商决定，对于这些被开除的职工做如下安排：在目前区属缴纳保险的机构补缴所欠之保险金，然后由区属保险部门去市局做开除文件的一个附属说明，即可保持工龄的连续。
我需要交纳９４-９６年的保险金３.５万余元。

请问补缴这３.５万元保险金有必要吗？如果不交，前面的工龄就不算了吗？